Physarum type – préparation d’agar

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[FR] Continuation du projet Physarum Type :

– Création d’une fonte typographique par ordinateur (processing – exportation vectorielle).

– Impression de la fonte qui servira pour déterminer la forme de l’amibe Physarum polycephalum (disposition de l’aliment de l’amibe calculée grâce à la transparence des boîtes de Petri).

– Préparation d’agar pour des nouveaux milieux de culture : bain marie des bouteilles d’agar 2%  jusqu’à qu’il fond, stérilisation du milieu, répartition sur les boîtes, couverture des boîtes.

– En autre, observation de l’organisme déjà mûr : développement d’esporanges, ce qui permet de semer des spores vers d’autres boîtes de Petri.

Projet en cours.

[ES] Continuación del projecto Physarum Type:

– Creación de una fuente tipográfica por ordenador (processing – exportación vectorial).

– Impresión de la fuente que servirá a determinar la forma de la ameba Physarum polycephalum (disposición del alimento de la ameba calculada gracias a la transparencia de las placas de Petri).

– Impression de la fonte qui servira pour déterminer la forme de l’amibe (disposition de l’aliment de l’amibe calculée par transparence des boîtes de Petri).

– Preparación de agar para nuevos medios de cultivo: baño maría de las botellas de agar al 2% hasta que éste se funde totalmente, esterilización del medio, distribución sobre placas de Petri, cobertura de las placas.

– Por otro lado, observación del organismo maduro : desarrollo de esporangios, lo cual permite sembrar esporas en las otras placas de Petri.

Projecto en curso.

[ENG] Continuation of the Physarum Type project:

– Creation of a computer typeface (processing – vector export).

– Print of the typeface; that will be used to determine the shape of the Physarum polycephalum amoeba (distribution of the amoeba food calculated thanks to the transparency of the Petri dishes).

– Preparation of agar for new culture dishes: Bain-Marie of the 2% agar bottles until melting is complete, sterilization of the environment, distribution over Petri dishes, covering of the dishes.

– On a side note, observation of the grown organism: developpement of the sporangium, which allows for planting spores in the other Petri dishes.

Work in Progress.

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Retour à La Paillasse

Labo loco

[FR] Hier je suis retourné à La Paillasse, le laboratoire citoyen dédié à la biologie, qui est accueilli actuellement par le /tmp/lab à Vitry sur Seine. En ce moment, nous sommes en train d’organiser un réseau de hackerspaces liés à la biologie (diybio.eu) à niveau éuropéen. Sinon, le laboratoire est toujours ouvert pour toutes les personnes qui s’intéressent à la biologie et au DIY.

[ES] Ayer volví a La Paillasse, el laboratorio comunitario de biología, que está acogido actualmente por el /tmp/lab en Vitry sur Seine (Francia). En este momento, estamos organizando una red de hackerspaces ligados a la biología (diybio.eu) a nivel europeo. Además, el laboratorio sigue abierto para todas las personas que se interesan por la biolgía y por el « hazlo tú mismo ».

[ENG] Yesterday I went back to La Paillasse, the community biology lab, which is currently hosted by the /tmp/lab at Vitry sur Seine (France). In this moment, we are organising a network of hackerspaces linked to biology (diybio.eu) at an European level. By the way, the lab is always open to those interested in DIYbio.

Avant/Antes/Previously: DIYbio Kickoff Meeting.

[FR] Par ailleurs, j’ai commencé à faire des expériences avec la biblithéque Flob pour Processing, qui permet de détecter et identifier (faire du tracking) des différents zones de contraste (blobs) sur une entrée vidéo. Pour qu’elle marche, il faut tenir en compte plusieurs facteurs :

1 ) Elle ne marche pas sur la dernière version de Processing, mais elle le fait sur la version 1.5 (voir Stable Releases).

2 )Pour qu’elle marche (après avoir reçu l’erreur The Constructor Flob […] is undefined) j’ai du remplacer cette partie du code :

flob = new Flob(this, video, width, height);

par celle-ci :

flob = new Flob(video, width, height);

3 ) Les zones à détecter doivent être des objets clairs sur un fond foncé. Je suis en train de chercher une manière d’inverser ce rapport.

[ES] En otro orden de cosas, he empezado a experimentar con la biblioteca Flob de Processing, que permite detectar e identificar (hacer tracking) diferentes zonas de contraste (blobs) de una entrada de vídeo. Para que funcione, hay que tener en cuenta los siguientes factores:

1 ) No funciona sobre la última versión de Processing, pero sí sobre la versión 1.5 (ver Stable Releases).

2 ) Para que funcione (después de recibir el error The Constructor Flob […] is undefined) tuve que reemplazar esta parte del código:

flob = new Flob(this, video, width, height);

por ésta:

flob = new Flob(video, width, height);

3 ) Las zonas a detectar deben ser objetos claros sobre un fondo oscuro. Estoy buscando una manera de invertir esta relación.

[ENG] Other than that, I’ve started experimenting with the Flob library for Processing, that allows for blob (contrast zones) multi-tracking on a live video input. In order for it to work, one has to take in account the following parameters:

1 ) It doesn’t work on the last version of Processing, but it does on version 1.5 (see Stable Releases).

2 ) For it to work (after receiving the The Constructor Flob […] is undefined error) I had to replace this part of the code:

flob = new Flob(this, video, width, height);

for this one:

flob = new Flob(video, width, height);

3 ) The areas to be detected must be light objects on a dark background. I’m looking for a way to invert this relation.